Resumen
En este trabajo se presenta un estudio de detección del Glaucoma y clasificación en estadíos (Sano, I, II, III y IV) a partir de las capas de fibras nerviosas de la mácula mediante distintos algoritmos de aprendizajes de aprendizaje automático (análisis discriminante lineal y regresión logística). Los estadíos se han generado mediante el algoritmo de K-medias (más info).
Para cada capa o combinación de capas de la mácula se presenta primero un modelo de clasificación binaria (Sano o Glaucoma) para dectectar el Glaucoma y después un modelo de clasifiación múltiple para clasificar el glaucoma en estadíos (I, II, III y IV).
Para evaluar a capacidad predictiva de cada modelo se utilizó validación cruzada y se repitió la construcción del modelo 10 veces.
Clasifiación binaria (glaucoma vs no glaucoma)
Todas las capas y celdas
Análisis discriminante
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación binario (sanos vs glaucomatosos) basado en análisis discriminate lineal usando todas las capas y celdas la mácula.
Metrica
|
Media
|
Error.std
|
n
|
Precisión global
|
0.8767
|
0.0070
|
10
|
AUC
|
0.8463
|
0.0165
|
10
|
Sensibilidd
|
0.5453
|
0.0338
|
10
|
Especificiad
|
0.9585
|
0.0076
|
10
|
Regresión logística
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación binario (sanos vs glaucomatosos) basado en regresión logística usando todas las capas y celdas la mácula.
Metrica
|
Media
|
Error.std
|
n
|
Precisión global
|
0.8497
|
0.0085
|
10
|
AUC
|
0.8210
|
0.0162
|
10
|
Sensibilidd
|
0.5506
|
0.0306
|
10
|
Especificiad
|
0.9236
|
0.0095
|
10
|
Capas significativas y todas las celdas
Analisis discriminante
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación binario (sanos vs glaucomatosos) basado en análisis discriminate lineal usando solo las capas con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos (RNFL, GCL e IPL) y todas las celdas la mácula.
Metrica
|
Media
|
Error.std
|
n
|
Precisión global
|
0.8798
|
0.0069
|
10
|
AUC
|
0.8540
|
0.0160
|
10
|
Sensibilidd
|
0.5351
|
0.0242
|
10
|
Especificiad
|
0.9652
|
0.0061
|
10
|
Regresión logística
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación binario (sanos vs glaucomatosos) basado en regresión logística usando solo las capas con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos (RNFL, GCL e IPL) y todas las celdas la mácula.
Metrica
|
Media
|
Error.std
|
n
|
Precisión global
|
0.8767
|
0.0079
|
10
|
AUC
|
0.8408
|
0.0166
|
10
|
Sensibilidd
|
0.5573
|
0.0321
|
10
|
Especificiad
|
0.9558
|
0.0069
|
10
|
Capas significativas y celdas significativas
Análisis discriminante
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación binario (sanos vs glaucomatosos) basado en análisis discriminate lineal usando solo las capas (RNFL, GCL e IPO) y las celdas con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos.
Metrica
|
Media
|
Error.std
|
n
|
Precisión global
|
0.8809
|
0.0078
|
10
|
AUC
|
0.8416
|
0.0198
|
10
|
Sensibilidd
|
0.5298
|
0.0293
|
10
|
Especificiad
|
0.9678
|
0.0070
|
10
|
Regresión logística
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación binario (sanos vs glaucomatosos) basado en regresión logística usando solo las capas (RNFL, GCL e IPO) y las celdas con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos.
Metrica
|
Media
|
Error.std
|
n
|
Precisión global
|
0.8756
|
0.0104
|
10
|
AUC
|
0.8334
|
0.0193
|
10
|
Sensibilidd
|
0.5570
|
0.0278
|
10
|
Especificiad
|
0.9545
|
0.0094
|
10
|
Capas significativas y celdas significativas con datos balanceados
Análisis discriminante
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación binario (sanos vs glaucomatosos) basado en análisis discriminate lineal usando solo las capas (RNFL, GCL e IPO) y las celdas con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos, y con el mismo número de ojos sanos que glaucomatosos.
Metrica
|
Media
|
Error.std
|
n
|
Precisión global
|
0.7553
|
0.0295
|
10
|
AUC
|
0.8329
|
0.0279
|
10
|
Sensibilidd
|
0.6921
|
0.0355
|
10
|
Especificiad
|
0.8153
|
0.0317
|
10
|
Regresión logística
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación binario (sanos vs glaucomatosos) basado en regresión logística usando solo las capas (RNFL, GCL e IPO) y las celdas con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos, y con el mismo número de ojos sanos que glaucomatosos.
Metrica
|
Media
|
Error.std
|
n
|
Precisión global
|
0.7520
|
0.0286
|
10
|
AUC
|
0.8344
|
0.0288
|
10
|
Sensibilidd
|
0.7342
|
0.0317
|
10
|
Especificiad
|
0.7689
|
0.0366
|
10
|
Clasificación en estadíos (incluyendo sanos)
Todas las capas y celdas
Análisis discriminante
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (incluyendo ojos sanos) basado en análisis discriminate lineal usando todas las capas y celdas la mácula.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: Sano
|
0.8648
|
0.6216
|
0.9022
|
0.5324
|
0.7432
|
Class: I
|
0.1628
|
0.9471
|
0.1296
|
0.9590
|
0.5550
|
Class: II
|
0.2206
|
0.9132
|
0.1667
|
0.9371
|
0.5669
|
Class: III
|
0.3778
|
0.9729
|
0.4146
|
0.9686
|
0.6754
|
Class: IV
|
0.6897
|
0.9878
|
0.6452
|
0.9900
|
0.8387
|
Regresión logística
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (incluyendo ojos sanos) basado en regresión logística usando todas las capas y celdas la mácula.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: Sano
|
0.7309
|
0.7243
|
0.9146
|
0.4000
|
0.7276
|
Class: I
|
0.1860
|
0.9156
|
0.0964
|
0.9588
|
0.5508
|
Class: II
|
0.3235
|
0.9016
|
0.2056
|
0.9442
|
0.6126
|
Class: III
|
0.3556
|
0.9324
|
0.2105
|
0.9661
|
0.6440
|
Class: IV
|
0.4828
|
0.9391
|
0.2029
|
0.9826
|
0.7109
|
Capas significativas y todas las celdas
Análisis discriminante
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (incluyendo ojos sanos) basado en análisis discriminate lineal usando solo las capas de la mácula con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos (RNFL, GCL e IPL) y todas las celdas la mácula.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: Sano
|
0.9478
|
0.5946
|
0.9042
|
0.7383
|
0.7712
|
Class: I
|
0.1860
|
0.9764
|
0.2759
|
0.9612
|
0.5812
|
Class: II
|
0.2647
|
0.9595
|
0.3396
|
0.9431
|
0.6121
|
Class: III
|
0.5333
|
0.9820
|
0.6000
|
0.9765
|
0.7576
|
Class: IV
|
0.7241
|
0.9934
|
0.7778
|
0.9912
|
0.8587
|
Regresión logística
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (incluyendo ojos sanos) basado en regresión logística usando solo las capas de la mácula con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos (RNFL, GCL e IPL) y todas las celdas la mácula.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: Sano
|
0.9317
|
0.5676
|
0.8969
|
0.6731
|
0.7496
|
Class: I
|
0.0930
|
0.9831
|
0.2105
|
0.9573
|
0.5381
|
Class: II
|
0.1471
|
0.9676
|
0.2632
|
0.9351
|
0.5573
|
Class: III
|
0.4444
|
0.9617
|
0.3704
|
0.9715
|
0.7031
|
Class: IV
|
0.5517
|
0.9679
|
0.3556
|
0.9853
|
0.7598
|
Capas significativas y celdas significativas
Análisis discriminante
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (incluyendo ojos sanos) basado en análisis discriminate lineal usando solo las capas de la mácula (RNFL, GCL e IPL) y las celdas con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: Sano
|
0.9424
|
0.6162
|
0.9084
|
0.7261
|
0.7793
|
Class: I
|
0.2326
|
0.9753
|
0.3125
|
0.9633
|
0.6039
|
Class: II
|
0.3088
|
0.9595
|
0.3750
|
0.9463
|
0.6342
|
Class: III
|
0.5333
|
0.9808
|
0.5854
|
0.9764
|
0.7571
|
Class: IV
|
0.7241
|
0.9922
|
0.7500
|
0.9912
|
0.8582
|
Regresión logística
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (incluyendo ojos sanos) basado en regresión logística usando solo las capas de la mácula (RNFL, GCL e IPL) y las celdas con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: Sano
|
0.9491
|
0.5459
|
0.8941
|
0.7266
|
0.7475
|
Class: I
|
0.0698
|
0.9876
|
0.2143
|
0.9564
|
0.5287
|
Class: II
|
0.1618
|
0.9803
|
0.3929
|
0.9369
|
0.5710
|
Class: III
|
0.6000
|
0.9707
|
0.5094
|
0.9795
|
0.7853
|
Class: IV
|
0.5862
|
0.9701
|
0.3864
|
0.9865
|
0.7782
|
Capas significativas y celdas significativas con datos balanceados
Análisis discriminante
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (incluyendo ojos sanos) basado en análisis discriminate lineal usando solo las capas de la mácula (RNFL, GCL e IPL) y las celdas con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos, y con un número de ojos sanos similar al de los demás estadios.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: Sano
|
0.6769
|
0.7189
|
0.7174
|
0.6786
|
0.6979
|
Class: I
|
0.2791
|
0.9139
|
0.2927
|
0.9086
|
0.5965
|
Class: II
|
0.3382
|
0.8141
|
0.2840
|
0.8495
|
0.5762
|
Class: III
|
0.5111
|
0.9284
|
0.4894
|
0.9339
|
0.7197
|
Class: IV
|
0.6552
|
0.9772
|
0.7037
|
0.9717
|
0.8162
|
Regresión logística
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (incluyendo ojos sanos) basado en regresión logística usando solo las capas de la mácula (RNFL, GCL e IPL) y las celdas con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos, y con un número de ojos sanos similar al de los demás estadios.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: Sano
|
0.7590
|
0.7297
|
0.7475
|
0.7418
|
0.7444
|
Class: I
|
0.2093
|
0.9139
|
0.2368
|
0.9006
|
0.5616
|
Class: II
|
0.2353
|
0.8622
|
0.2712
|
0.8380
|
0.5487
|
Class: III
|
0.5111
|
0.9015
|
0.4107
|
0.9321
|
0.7063
|
Class: IV
|
0.5172
|
0.9601
|
0.5172
|
0.9601
|
0.7387
|
Clasificación en estadíos (sin incluir sanos)
Todas las capas y celdas
Análisis discriminante
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (sin incluir ojos sanos) basado en análisis discriminate lineal usando todas las capas y celdas la mácula.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: I
|
0.1860
|
0.7606
|
0.1905
|
0.7552
|
0.4733
|
Class: II
|
0.2353
|
0.7949
|
0.4000
|
0.6414
|
0.5151
|
Class: III
|
0.2222
|
0.6929
|
0.1887
|
0.7348
|
0.4575
|
Class: IV
|
0.3448
|
0.7436
|
0.2000
|
0.8593
|
0.5442
|
Regresión logística
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (sin incluir ojos sanos) basado en regresión logística usando todas las capas y celdas la mácula.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: I
|
0.3721
|
0.8380
|
0.4103
|
0.8151
|
0.6051
|
Class: II
|
0.3529
|
0.6496
|
0.3692
|
0.6333
|
0.5013
|
Class: III
|
0.3778
|
0.7429
|
0.3208
|
0.7879
|
0.5603
|
Class: IV
|
0.4828
|
0.9103
|
0.5000
|
0.9045
|
0.6965
|
Capas significativas y todas las celdas
Análisis discriminante
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (sin incluir ojos sanos) basado en análisis discriminate lineal usando solo las capas de la mácula con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos (RNFL, GCL e IPL) y todas las celdas.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: I
|
0.1860
|
0.7465
|
0.1818
|
0.7518
|
0.4663
|
Class: II
|
0.2941
|
0.7179
|
0.3774
|
0.6364
|
0.5060
|
Class: III
|
0.1556
|
0.7857
|
0.1892
|
0.7432
|
0.4706
|
Class: IV
|
0.2069
|
0.7115
|
0.1176
|
0.8284
|
0.4592
|
Regresión logística
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (sin incluir ojos sanos) basado en regresión logística usando solo las capas de la mácula con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos (RNFL, GCL e IPL) y todas las celdas.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: I
|
0.5349
|
0.7817
|
0.4259
|
0.8473
|
0.6583
|
Class: II
|
0.3676
|
0.7350
|
0.4464
|
0.6667
|
0.5513
|
Class: III
|
0.4667
|
0.8357
|
0.4773
|
0.8298
|
0.6512
|
Class: IV
|
0.4828
|
0.8910
|
0.4516
|
0.9026
|
0.6869
|
Capas significativas y celdas significativas
Análisis discriminante
Medidas de evaluación de la capacidad predictiva del modelo de clasificación en estadios de glaucoma (sin incluir ojos sanos) basado en análisis discriminate lineal usando solo las capas (RNFL, GCL e IPL) y las celdas de la mácula con diferencias significativas entre sanos y glaucomatosos.
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: I
|
0.1860
|
0.7113
|
0.1633
|
0.7426
|
0.4487
|
Class: II
|
0.2647
|
0.7009
|
0.3396
|
0.6212
|
0.4828
|
Class: III
|
0.2000
|
0.7643
|
0.2143
|
0.7483
|
0.4821
|
Class: IV
|
0.2414
|
0.7821
|
0.1707
|
0.8472
|
0.5117
|
Regresión logística
|
Sensibilidad
|
Especificidad
|
VPP
|
VPN
|
Precisión global
|
Class: I
|
0.5349
|
0.8592
|
0.5349
|
0.8592
|
0.6970
|
Class: II
|
0.4265
|
0.7179
|
0.4677
|
0.6829
|
0.5722
|
Class: III
|
0.4889
|
0.8429
|
0.5000
|
0.8369
|
0.6659
|
Class: IV
|
0.5862
|
0.8782
|
0.4722
|
0.9195
|
0.7322
|